Japan-Places.com a répertorié environ 164 Musée archéologique dans Japon. Certains des mieux notés Musée archéologique dans Japon sont- Musée Shakado de la culture Jomon, Musée préfectoral d'Osaka de la culture Yayoi, Jomon Jiyukan, Préfecture de Wakayama Musée d'archéologie et de folklore Kii-fudoki-no-oka, Musée archéologique d'Ibusuki, Musée de l'ancien tumulus de la préfecture de Kumamoto, Musée Toro de la ville de Shizuoka, Ozuka-kofun, Musée Wakasa Mikata Jomon Bâtiment DOKIDOKI & Musée Shibayama Kofun Haniwa.