Japan-Places.com a répertorié environ 540 Églises protestantes dans Japon. Certains des mieux notés Églises protestantes dans Japon sont- Église de Kamari, Église UCCJ de Kobe, Église biblique de Fukuoka, Église chrétienne japonaise Église Kobe Seiai, Église de Kamata, Igreja Bétel Suzuka, Église chrétienne japonaise Église Sendai Aobaso, Église évangélique de Tokyo Shibuya, Église Asakusa de l'Église chrétienne japonaise & Église UCCJ de Sugamo.